江西科学家破译花榈木“遗传密码”

染色体级别花榈木全基因组(图源:江西省林业科学院)
大江网/大江新闻客户端讯 全媒体记者沈冠楠报道:继江西科学家破解“雷竹”全基因组,江西省林业科学院再传来喜讯。该院联合省林业科技实验中心在期刊《Scientific Data》(中国科学院二区期刊,5年影响因子8.7)发表题为“Chromosome-level genome assembly of the endangered tree species Ormosia henryi Prain”研究论文,在国内率先获得首个染色体级别花榈木全基因组,填补了花榈木遗传学研究的空白。
说起花榈木,你或许较为陌生,但一定听过“花梨木”。没错,“花梨木”就是花榈木的民间叫法。作为豆科、红豆属常绿乔木,花榈木被誉为“才貌双全”树,其在我国的应用史可追溯到唐代,可谓“全身都是宝”——外形树大荫浓,树干挺拔,寿命长且虫害少,是优秀的景观树。木材是上等木料,大名鼎鼎的龙泉宝剑,其剑鞘就是用花榈木做成的。根、根皮、茎及叶均可入药,提取物还可稳定人体中枢神经系统。另外,果实成熟时状如红豆,又使花榈木成了“爱情树”。
为何要开展花榈木的遗传学研究?原来,花榈木因种子自然萌发率低,加之环境影响等种种原因,野生种群资源稀少,属于我国珍稀濒危树种,为国家二级保护野生植物,被《中国物种红色名录》《国家重点保护野生植物名录》收录。
记者了解到,花榈木集中分布于我国东南部地区,其中核心分布区主要位于江西、湖南、福建等省区,野外种群极少。2020年,江西省瑞金市赣江源保护区发现了野生花榈木的身影;2023年,江西省彭泽县桃红岭梅花鹿国家级自然保护区也发现小群落,包括3株成熟乔木和12株幼苗,处于良好的自然野生状态。
抢救这一珍稀树种,“基因方案”有望给出答案。
研究表明,花榈木基因组总大小为2.69Gb,BUSCO评估验证基因组完整性达98.20%,其中共功能注释到37366个基因,鉴定到2518个rRNA和1120个tRNA等非编码RNA,为红豆属物种里少有的大基因组。
该成果的发布,为解析豆科基因组扩张机制提供了新视角,同时为花榈木药用成分生物合成途径的解析及红豆属相关濒危物种的保护与资源综合开发利用提供了重要分子依据与理论基础。
此外,记者也了解到,研究团队在前期资源收集、群体遗传结构解析基础上,首次发现了花榈木树体挥发性成分中21种抗抑郁成分及4种核心物质,论证了该树种抗抑郁森林康养价值。
据悉,近10年来,省林业科技实验中心与省林科院联合开展花榈木资源保护、评价与可持续利用技术研究,在全省野外回归种植1.2万株。